Novidade Evolutiva
Ferramentas e novidades científicas
Ferramentas e novidades científicas
Codon - executando códigos Python até 100 vezes mais rápidos
29ª edição
O Python está entre as linguagens de programação mais populares da atualidade. No entanto, ela possui uma grande limitação quando se trata de velocidade em comparação com outras linguagens. Pensando nisso, pesquisadores do MIT desenvolveram a ferramenta Codon, que ajudará os nativos do Python a desenvolverem programas mais eficientes e com velocidades comparáveis a de uma linguagem compilada.
Bioinformática no desvendamento de crimes
29ª edição
Conheça através desta matéria a fascinante área da Bioinformática forense e de como ela auxiliou no desvendamento de um crime após 40 anos sem solução
Programando com Spark RDDs
20ª edição
A busca por ferramentas capazes de lidar com grande volume de dados gerados diariamente é uma das prioridades das últimas décadas e o Spark vem se mostrando uma excelente alternativa. Dando continuidade a série Spark, nesta matéria explicaremos como funciona o Spark RDD (Resilient Distributed Dataset).
As ultra-long-reads vão transformar a genômica?
19ª edição
Métodos de sequenciamento de short-reads enfrentam problemas para resolver genomas grandes e complexos, especialmente em regiões repetitivas ou ricas em CG. Nos últimos anos alguns trabalhos estão usando ultra-long-reads para solucionar regiões genômicas anteriormente problemáticas, aumentando o conhecimento genético e evolutivo de espécies chaves.
O uso da Bioinformática na preservação de espécies
18ª edição
Que tal conhecer uma planta que cresce entre rochas e grandes quantidades de minérios? A espécie endêmica de Carajás (Pará) _Isoetes cangae_ vive dentro de um lago com poucos nutrientes, cercada por rochas e em constante incidência de altas temperaturas à luz do sol. Incrível, não é? Mas como preservar uma espécie com características tão exigentes? A bioinformática pode te surpreender sobre como a análise genética da planta pode fornecer informações valiosas e propiciar a ela o ambiente ideal de sobrevivência.
Algoritmos Genéticos
17ª edição
A teoria da evolução, formulada por Charles Darwin, é o cerne da biologia e revolucionou vários aspectos sociais e filosóficos na época em que surgiu. E se dissermos que 129 anos depois do surgimento dessa teoria, um filósofo propôs a ideia de que a evolução é inevitável, que uma vez que os devidos pré-requisitos estejam presentes, ela funciona como um algoritmo? De lá para cá muita coisa foi se desenvolvendo, e hoje em dia temos toda uma linha de estudo baseada em algoritmos evolutivos que têm como principal objetivo “selecionar” soluções para problemas específicos.
Spark e sua Instalação em uma Máquina Local
17ª edição
Já pensou em processar dados em larga escala de forma paralela e distribuída no seu próprio computador? O Apache Spark pode ser uma excelente opção caso você deseje fazer isso sem se preocupar com muitos detalhes técnicos. Nesse tutorial iremos apresentar o que é a ferramenta e como instalá-la na sua máquina local.
Qiime 2 - Desvendando Microbiomas
16ª edição
Eu tenho certeza que você já ouviu falar sobre microbiomas, aquele conjunto de microorganismos que vivem em associação com outros organismos. Mas você já se perguntou como fazemos para analisar essa infinidade de informações? O Qiime é uma ferramenta que ajuda os bioinformatas nesta árdua tarefa.
Sequenciamento de perturbações causadas in vivo aponta o papel de genes de risco para o desenvolvimento do transtorno de espectro autista
16ª edição
Pesquisadores da Universidade de Harvard e do Instituto de BROAD utilizaram um protocolo inovador de edição gênica em larga escala e sequenciamento de células únicas, o Perturb-Seq, para identificar o impacto de mutações em genes associados ao transtorno de espectro autista (TEA) em diferentes tipos celulares de ratos. Os resultados foram reforçados por dados obtidos em seres humanos e abrem as portas para que mais estudos da mesma natureza sejam realizados.
Arsenal para enfrentar o Big Data
16ª edição
Extrair benefícios do Big Data requer estratégias e planejamento diferenciado e proporcional a sua dimensão. Conheça através desta matéria algumas das abordagens utilizadas para domar o Big Data.
Metagenômica: do ambiente aos bytes
15ª edição
O que é a metagenômica? Para quê serve? E como é realizado? Existem diversas opções de ferramentas de bioinformática para fazer este tipo de análise, veja nesta matéria conceitos da metagenômica e exemplos de programas voltados para análises de classificação taxonômica dos microrganismos presentes em um ambiente.
Primeiro sequenciamento completo de um cromossomo autossomo humano
14ª edição
A montagem do cromossomo autossomo humano 8 preenche lacunas no genoma referência (GRCh38) e oferece pistas evolutivas.
Como os genes determinam o seu rosto?
13ª edição
Pesquisa publicada em dezembro de 2020 aponta uma centena de variantes genéticas (dentre as estimadas milhares) responsáveis por essas características.
A Bioinformática no desenvolvimento de medicamentos
12ª edição
Já reparou como a quantidade de medicamentos tem aumentado nos últimos anos? E em como, em tão pouco tempo, surgem novos medicamentos com efeitos colaterais cada vez menores? Veja nesta matéria um pouco sobre a história, as aplicações e as metodologias computacionais aplicadas no desenho racional de medicamentos.
Recursos para a escrita acadêmica - Latex
10ª edição
Chegou a hora de escrever e formatar sua dissertação, tese ou mesmo seu artigo científico. Qual plataforma utilizar nessa hora? Aqui abordaremos o sistema de preparação de documentos LaTeX, contando um pouco sobre sua origem, vantagens e trazendo exemplos base de como utilizá-lo.
Cursos Online em Bioinformática e áreas correlatas
10ª edição
Veja nossas dicas e indicações de cursos online na área de Bioinformática oferecidos por instituições nacionais e internacionais.
Ferramentas que auxiliam na escrita acadêmica e organização de referências
9ª edição
Quais recursos que seu grupo de pesquisa usa na hora de elaborar relatórios e artigos? Você tem alguma outra ferramenta preferida? Gostaria de conhecer alternativas? Hoje falamos um pouco sobre ferramentas populares utilizadas na escrita acadêmica e para organizar referências.
Conda, Miniconda, Bioconda e Anaconda
7ª edição
Como utilizar um gerenciador de ambientes para escapar do "Inferno de Dependências" ao trabalhar com computação científica.
MBSP1, uma nova proteína biossurfactante
6ª edição
Pesquisadores da UFRN utilizam metagenômica para descobrir nova proteína capaz de recuperar solos contaminados por petróleo de forma sustentável.
HuBMAP - Programa para um atlas biomolecular humano
3ª edição
O projeto HuBMAP (The Human BioMolecular Atlas Program) planeja combinar informações de anatomia, histologia e dados de ômicas (genômica…
ORF Length and GC Content
2ª edição
RNAs longos não-codantes (lncRNAs) são um dos diversos tipos de RNA não-codante. Essas moléculas estão envolvidas em processos biológicos…
Brincando com Pandas
1ª edição
Quando o assunto é apresentação de dados, é muito comum fazer uso de tabelas, seja qual for o tema. Pacotes de software como Microsoft…