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Introdução à Análise de Dados de Sequenciadores de Segunda Geração


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sobre o curso

O curso teórico-prático em Introdução à Análise de Dados de Sequenciadores de Segunda Geração, com carga horária de 24h acontecerá em Natal — RN, nas dependências do Instituto do Cérebro da Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN), de 19 a 21 de setembro de 2022. O curso será promovido pelo BioME, o núcleo de Bioinformática do IMD-UFRN, com apoio do Programa de Pós Graduação em Bioinformática da UFRN e do Instituto de Bioinformática e Biotecnologia (2Bio), sendo ministrado pelo Prof. Dr. Jorge Estefano Santana de Souza.

Público Alvo

Estudantes de graduação, pós-graduação e profissionais que necessitam obter treinamento básico para iniciar análises de dados de sequenciadores de segunda geração.

Valor: R$ 300,00

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Palestrante

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Jorge Estefano Santana de Souza

IMD-UFRN

Formado em Ciências da Computação pela Universidade de Santo Amaro e doutor em Bioinformática pela Universidade de São Paulo. Tem experiência na área de Genética com ênfase em Bioinformática e Genômica, atuando principalmente nos seguintes temas: Câncer, Biologia Molecular, Genômica e Transcriptômica. Atuou na área de Bioinformática no Ludwig Institute for Cancer Research, e atualmente é professor adjunto no Instituto Metrópole Digital da Universidade Federal do Rio Grande do Norte (IMD/UFRN), colaborador do Instituto de Bioinformática e Biotecnologia (2Bio) e colaborador da equipe de Bioinformática do International Research Center, CIPE/AC Camargo Cancer Center.

Programação

Dia 1 (19/09)

09:00 - 12:00
Pipelines de NGS data analysis.

Sequenciadores de segunda geração.

Protocolos de sequenciamento.

Tipos de análise.

12:00 - 13:00
Almoço

Pausa para o Almoço

13:00 – 17:00
Introdução à Bioinformática e Análise de qualidade

Programas

Práticas

Formatos

Dia 2 (20/09)

09:00 – 12:00
Prática de chamada de variants

Alinhadores

Chamada de variants

Filtros

Anotadores

12:00 - 13:00
Almoço

Pausa para o Almoço

13:00 – 17:00
Prática de RNASeq

Alinhadores

Quantificação da expressão

Expressão diferencial

Dia 3 (21/09)

09:00 – 12:00
Prática de RADSeq

Usando o iPyRAD

Quantificação da expressão

Estimativas para haplótipos