Curso de curta duração

1º Curso teórico-prático em Introdução à Análise de Dados de Sequenciadores de Segunda Geração

BioME - Centro Multiusuário de Bioinformática - UFRN

Local: Instituto Metrópole Digital

O Evento

O "1º Curso teórico-prático em Introdução à Análise de Dados de Sequenciadores de Segunda Geração" com carga horária de 20h acontecerá em Natal - RN, nas dependências do Instituto Metrópole Digital da Universidade Federal do Rio Grande do Norte (IMD - UFRN), de 19 a 21 de Julho de 2017. O curso será promovido pelo BioME, o núcleo de Bioinformática do IMD-UFRN, com apoio do Programa de Pós Graduação em Bioinformática da UFRN e do Instituto de Bioinformática e Biotecnologia (2Bio), sendo ministrado pelo Prof. Dr. Jorge Estefano Santana de Souza.

Público Alvo:
Estudantes de graduação, pós-graduação e profissionais que necessitam obter treinamento básico para iniciar análises de dados de sequenciadores de segunda geração.

Programa

14:00 - 14:10

Abertura

14:10 - 18:00

Introdução de Bioinformática

Noções básicas de Linux
Bancos de dados relacionais - MySQL
Principais bancos de dados disponíveis - GenBank,Uniprot, etc.
Alinhamento
9:00 - 12:00

Pipelines de NGS data analysis

Sequenciadores de segunda geração
Protocolos de sequenciamento
Tipos de análise
Pipelines online e suas limitações
14:00 - 15:30

Prática de chamada de variantes

Alinhadores
Análise de qualidade
15:30 - 16:00

Coffe Break

16:00 - 18:00

Prática de chamada de variantes

Chamada de variantes
Filtros
Anotadores
9:00 - 12:00

Prática de RNASeq I

Alinhadores
Análise de qualidade
Quantificação da expressão
Expressão diferencial
14:00 - 15:30

Prática de RNASeq II

Análise de RNA não-codantes
Análise de microRNA
15:30 - 16:00

Coffe Break

16:00 - 18:00

Prática de RNASeq II

Identificação de micros novos
Expressão diferencial
18:00

Encerramento

Palestrante

Jorge Estefano Santana de Souza

IMD - UFRN

Formado em Ciências da Computação pela Universidade de Santo Amaro e doutor em Bioinformática pela Universidade de São Paulo. Tem experiência na área de Genética com ênfase em Bioinformática e Genômica, atuando principalmente nos seguintes temas: Câncer, Biologia Molecular, Genômica e Transcriptômica. Atuou na área de Bioinformática no Ludwig Institute for Cancer Research, e atualmente é professor adjunto no Instituto Metrópole Digital da Universidade Federal do Rio Grande do Norte (IMD/UFRN), colaborador do Instituto de Bioinformática e Biotecnologia (2Bio) e colaborador da equipe de Bioinformática do International Research Center, CIPE/AC Camargo Cancer Center.
Mais informações: CV Lattes

Informações

Local: IMD, sala A103

Carga horária: 20h

Vagas limitadas

Data limite para inscrição: 30 de Junho de 2017


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OBS: O curso será ministrado em um laboratório de informática e todos os materiais necessários para a realização serão fornecidos pela organização.
Portanto, não é necessário o uso de computadores pessoais.

Inscrição

Página de Inscrição (Inscrições Encerradas!)

Preço único: R$ 300,00
Caso deseje participar da lista de espera,
enviar email para biome@imd.ufrn.br
e você será notificado de sua posição por email.




Filogenia Molecular e Análise Evolucionária de Sequências

Análise proteômica - conceitos e aplicações

Inscritos em dois ou três cursos de curta duração de 2017, receberão um voucher de 20% para eventos futuros do BioME.
(O voucher será enviado para o email cadastrado após conferência dos dados de inscrição)

Organização

Gisele Tomazella

Instituto de Bioinformatica e Biotecnologia

Jorge Estefano Santana

IMD - UFRN

Maria Santana Braga

Instituto de Bioinformatica e Biotecnologia

Rodrigo Romão

BioME - UFRN

Sandro de Souza

BioME - UFRN

Colaboradores

IMD

O Instituto Metrópole Digital (IMD) é uma Unidade Suplementar da Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN), que atua na formação de pessoal de nível técnico, superior e na pós-graduação. Situado no bairro de Lagoa Nova e a menos de 9km da Praia de Ponta Negra, chega-se facilmente ao IMD de carro (taxi, uber) ou de ônibus (linha 66, a cada 10 minutos). O Instituto conta com diversas facilidades, tais como cantina e rede wi-fi. Mais informações em: IMD

Sobre Natal

Natal é a capital e maior cidade do estado do Rio Grande do Norte, localizada no Nordeste do Brasil. Até a data do último censo, a cidade teve uma população total de 862.044 habiatantes. Os principais hotéis da cidade estão concentrados na Via Costeira, uma longa avenida situada entre a costa e as dunas, além da Praia de Ponta Negra, a praia mais famosa da capital e a mais visitada pelos turistas. Natal tem várias atrações turísticas e é famosa por sua beleza natural (como as águas cristalinas de Maracajaú e o maior cajueiro do mundo), por seus monumentos e edifícios históricos (como o Forte dos Reis Magos, o Teatro Alberto Maranhão e a ponte Newton Navarro) e pelas suas praias (Ponta Negra, Pipa e Genipabu). A cidade também possui o segundo maior parque urbano do Brasil, o Parque das Dunas.

Contato

biome@imd.ufrn.br
+55 (84) 9 9422-6560 (WhatsApp)