O Evento

O curso teórico-prático de “Proteogenômica: Integrando Dados de NGS e Espectrometria de Massas” de curta duração com carga horária de 20h do Centro Multiusuário de Bioinformática da UFRN acontecerá em Natal - RN, nas dependências do Instituto Metrópole Digital da Universidade Federal do Rio Grande do Norte (IMD - UFRN), 18 a 20 de Julho de 2018. O curso será promovido pelo BioME, com apoio do Programa de Pós Graduação em Bioinformática da UFRN e do Instituto de Bioinformática e Biotecnologia (2Bio), sendo ministrado pelo Prof. Dr. Gustavo A. de Souza e pelo Prof. Dr. Sandro J. de Souza.

Público Alvo:
Estudantes de graduação, pós-graduação e profissionais que necessitam adquirir conhecimentos gerais em proteogenômica, tais como aplicações, estatrégias e ferramentas utilizadas.

Palestrantes

Gustavo A. de Souza

BioME

Biólogo formado pela Universidade Federal do Paraná, mestre e doutor em Biologia Celular e Molecular pela Universidade de São Paulo, e especialista em proteoma com pós-doutorado realizado com o Dr. Matthias Mann no Departamento de Proteômica e Tradução de Sinais do Instituto Max-Planck em Munique, na Alemanha. Atuou como Pesquisador Principal junto a Universidade de Oslo, Noruega, atuando principalmente nos seguintes temas: proteoma, proteogenoma, modificações pós-traducionais, doenças autoimunes, e caracterização de células T primárias. Atualmente, é Professor Associado afiliado ao Instituo do Cérebro da Universidade Federal do Rio Grande do Norte (ICe - UFRN), colaborador do Instituto de Bioinformática e Biotecnologia (2Bio), e membro do corpo de pesquisadores do Centro Multiusuário de Bioinformática (CMB/IMD/UFRN).
Mais informações: CV Lattes

Sandro J. de Souza

ICe-UFRN, BioME

Formado em Ciências Biológicas pela Universidade Federal do Paraná (1989) e doutor em Bioquímica pela Universidade de São Paulo (1993). De 1995 a 1998, foi Pew Latin American Fellow na Universidade de Harvard. Foi um dos pioneiros da genômica e da Bioinformática no Brasil. Foi membro associado do Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer de 1999 a 2012. Eleito pelo Fórum Econômico Mundial como um Young Global Leader em 2009. Foi Tinker Visiting Professor na Universidade de Chicago em 2011. Atualmente é Professor Titular do Instituto do Cérebro da UFRN. 
Mais informações: CV Lattes

Programa

14:00 - 14:45

Introdução à Proteogenômica: conceitos e aplicações

14:45 - 15:30

Next Generation Sequencing

Introdução à análise de dados de NGS
15:30 - 16:00

Coffe Break

16:00 - 18:00

Next Generation Sequencing

Chamada de variantes
RNA-Seq
9:00 - 12:00

Proteômica

Considerações gerais (métodos bottom-up, identificação de peptídeos)
Proteômica quantitativa (foco em label-free)
Integração de dados: formato dos outputs, meta-análise e normalização de dados independentes
12:00 - 14:00

Almoço

14:00 - 15:30

Proteogenômica

Predição de regiões codificadoras do genoma: limitações e exemplos
Método de tradução em 6-frames e outras abordagens para genomas simples
15:30 - 16:00

Coffe Break

16:00 - 18:00

Proteogenômica

Métodos baseados em RNA-Seq/cDNA para genomas complexos
Integrando dados, visualização
9:00 - 12:00

Aula prática - Proteogenomics Viewer

Executando e explorando os resultados
Por dentro da lógica de programação
Mapeamento de peptídeos em proteínas
12:00 - 14:00

Almoço

14:00 - 15:30

Aula prática - Proteogenomics Viewer

Mapeamento de proteínas no genoma
Integração de dados: peptídeos --> proteínas --> genoma
15:30 - 16:00

Considerações finais

16:00 - 18:00

Espaço aberto para discussão de projetos

Informações

Local: IMD, sala A305

Carga horária: 20h

Vagas limitadas: 40

Preço único: R$ 310,00

Encerramento das inscrições: 28/06


OBS: O curso será ministrado em um laboratório de informática
e todos os materiais necessários para a realização serão fornecidos pela organização.
Portanto, não é necessário o uso de computadores pessoais.

IMD

O Instituto Metrópole Digital (IMD) é uma Unidade Suplementar da Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN), que atua na formação de pessoal de nível técnico, superior e na pós-graduação. Situado no bairro de Lagoa Nova e a menos de 9km da Praia de Ponta Negra, chega-se facilmente ao IMD de carro (taxi, uber) ou de ônibus (linha 66, a cada 10 minutos). O Instituto conta com diversas facilidades, tais como cantina e rede wi-fi. Mais informações em: IMD