O Evento

O “Curso teórico-prático em Introdução à análise de dados de sequenciadores de segunda geração” de curta duração com carga horária de 20h do Centro Multiusuário de Bioinformática da UFRN acontecerá em Natal - RN, nas dependências do Instituto Metrópole Digital da Universidade Federal do Rio Grande do Norte (IMD - UFRN), de 29 a 31 de Janeiro de 2018. O curso será promovido pelo BioME, com apoio do Programa de Pós Graduação em Bioinformática da UFRN e do Instituto de Bioinformática e Biotecnologia (2Bio), sendo ministrado pelo Prof. Dr. Jorge Estefano Santana de Souza.

Público Alvo:
Estudantes de graduação, pós-graduação e profissionais que necessitam obter treinamento básico para iniciar análises de dados de sequenciadores de segunda geração.





Curso teórico de bioinformática básica

Curso teórico-prático de Introdução ao R para bioinformática







Palestrante

Jorge Estefano Santana de Souza

IMD/UFRN, BioME

Formado em Ciências da Computação pela Universidade de Santo Amaro e doutor em Bioinformática pela Universidade de São Paulo. Tem experiência na área de Genética com ênfase em Bioinformática e Genômica, atuando principalmente nos seguintes temas: Câncer, Biologia Molecular, Genômica e Transcriptômica. Atuou na área de Bioinformática no Ludwig Institute for Cancer Research, e atualmente é professor adjunto no Instituto Metrópole Digital da Universidade Federal do Rio Grande do Norte (IMD/UFRN), colaborador do Instituto de Bioinformática e Biotecnologia (2Bio) e colaborador da equipe de Bioinformática do International Research Center, CIPE/AC Camargo Cancer Center.
Mais informações: CV Lattes

Programa

9:00 - 9:15

Apresentação

9:15 - 12:00

Introdução de Bioinformática

Noções básicas de Linux
Principais banco de dados
Alinhamento
12:00 - 14:00

Almoço

14:00 - 15:30

Pipelines de NGS data analysis

Sequenciadores de segunda geração
Protocolos de sequenciamento
15:30 - 16:00

Coffee Break

16:00

Tipos de análise

Análise de qualidade
9:00 - 12:00

Prática de chamada de variantes

Alinhadores
Chamada de variantes
Filtros
Anotadores
12:00 - 14:00

Almoço

14:00 - 15:30

Prática de RNASeq I

Alinhadores
15:30 - 16:00

Coffe Break

16:00

Quantificação da expressão

Expressão diferencial
9:00 - 12:00

Prática de RNASeq II

RNA não-codantes
Analise de microRNA
12:00

Encerramento

Informações

Local: IMD, sala a confirmar

Carga horária: 20h


OBS: O curso será ministrado em um laboratório de informática e todos os materiais necessários para a realização serão fornecidos pela organização.
Portanto, não é necessário o uso de computadores pessoais.

Organização

Gisele Tomazella

2Bio, BioME

Maria Santana Braga

2Bio, BioME

Rodrigo Romão

PPg-Bioinfo, BioME

Sandro de Souza

ICE/UFRN, BioME

Rodrigo Dalmolin

DBQ/UFRN, BioME

Jorge E. S. de Souza

IMD/UFRN, BioME

Colaboradores


IMD

O Instituto Metrópole Digital (IMD) é uma Unidade Suplementar da Universidade Federal do Rio Grande do Norte (UFRN), que atua na formação de pessoal de nível técnico, superior e na pós-graduação. Situado no bairro de Lagoa Nova e a menos de 9km da Praia de Ponta Negra, chega-se facilmente ao IMD de carro (taxi, uber) ou de ônibus (linha 66, a cada 10 minutos). O Instituto conta com diversas facilidades, tais como cantina e rede wi-fi. Mais informações em: IMD

Sobre Natal

Natal é a capital e maior cidade do estado do Rio Grande do Norte, localizada no Nordeste do Brasil. Até a data do último censo, a cidade teve uma população total de 862.044 habiatantes. Os principais hotéis da cidade estão concentrados na Via Costeira, uma longa avenida situada entre a costa e as dunas, além da Praia de Ponta Negra, a praia mais famosa da capital e a mais visitada pelos turistas. Natal tem várias atrações turísticas e é famosa por sua beleza natural (como as águas cristalinas de Maracajaú e o maior cajueiro do mundo), por seus monumentos e edifícios históricos (como o Forte dos Reis Magos, o Teatro Alberto Maranhão e a ponte Newton Navarro) e pelas suas praias (Ponta Negra, Pipa e Genipabu). A cidade também possui o segundo maior parque urbano do Brasil, o Parque das Dunas.

Contato

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